Сделали расходную накладную, потом возврат от покупателя. В возврате выручка сторнируется, а себестоимость - нет.

Себестоимость возвращаенных покупателем товаров в конфигурации 1C "Управление небольшой фирмой" рассчитывается при проведении документа "Закрытие месяца".